Séquencer Paralvinella sulfincola, Desbruyères & Laubier, 1993

Après une période faste, il y a quelques années, les temps ne sont plus tant que ça au séquençage des génomes d’invertébrés marins. Exception à la règle, le CSP2009 du JGI inclut un nouvel annélide, le troisième après Capitella capitata et Helobdella robusta, la sangsue, il s’agit de Paralvinella sulfincola qui vit dans des conditions infernales de température et de pression, près des sources hydrothermales des dorsales océaniques. Ce polychète de la famille des alvinellidés qui comprend également le vers de pompéi, Alvinella pompejana (en 3D ici) est capable de supporter des températures très élevées, ce qui lui permet de se nourrir en filtrant les bactérie extrêmophiles qui se développent dans les émanations des sources chaudes. Des expériences en conditions contrôlées (Girguis & Lee, 2006) ont permis de montrer que la température de vie idéale de Paralvinella était de 40 à 50° et qu’il pouvait supporter jusqu’à 60°, ce qui fait de cet organisme l’animal le plus résistant à la chaleur sur la terre. Le séquençage de son génome proposés par  Peter Girguis (Harvard) et Stéphane Houdez (Roscoff) devrait permettre dans les années qui viennent de percer à jour les bases moléculaire de cette adaptation à des conditions extrêmes. Par exemple, les Heat shock proteins (HSPs) permettent aux cellules de supporter des conditions stressantes car elles maintiennent une conformation correcte des autres protéines que la chaleur tend à dénaturer. D’autres mécanismes de ce type permettent certainement à Paralvinella de supporter des condition de vie si particulières. 

J’en profite pour rendre hommade à Lucien Laubier, océanographe biologique et ancien directeur du Centre d’Océanologie de Marseille qui abrite mon laboratoire à la Station Marine d’Endoume, qui est décédé brusquement en juin dernier. En préparant ce post, je me suis en effet aperçu qu’il était à l’origine de la description de la famille des Alvinellidés en 1986 et de l’espèce Paralvinella sulfincola en 1993. J’avais eu quelques très discussion très enrichissantes avec ce grand naturaliste, notamment sur les rhabdopleures du coralligène et les avancées de l’ère génomique de doivent pas nous faire oublier notre dette à l’égard de cette génération d’explorateur qui ont façonné notre vision de la diversité du vivant.  

Références

TUNNICLIFFE V, DESBRUYERES D, JOLLIVET D, LAUBIER L. Systematic and ecological characteristic of Paralvinella sulfincola Desbruyères and Laubier, a new polychaet (family Alvinellidae) from northeast Pacific hydrothermal vents.  Canadian journal of zoology, vol. 71; 1993. p. 286-297  

DESBRUYERES D, LAUBIER L. Les Alvinellidae, une famille nouvelle d’annélides polychètes inféodés aux sources hydrothermales sous-marines : systématique, biologie et écologie. Canadian journal of zoology, vol. 64, n° 10+; 1986. p. 2227-2245